نیمار متولد شهر موگی داس کروزس در ایالت سائوپائولو برزیل است نام کاملش نیمار داسیلوا سانتوس جونیور برگرفته از نام پدرش نیمار داسیلوا سنیور است. پدرش قبلا یک فوتبالیست بود و نیمار تنها یک خواهر بنام رافائل سانتوس دارد.
فوتبال را از آکادمی باشگاه پورتوگوئستا سانتیستا در 7 سالگی شروع کرد و تا 11 سالگی آنجا بود، سپس از سال 2003 وقتی 11 ساله بود به جوانان باشگاه سانتوس پیوست. بعد از 6 سال بازی برای جوانان این تیم در سال 2009 وقتی 17 ساله بود وارد تیم بزرگسالان سانتوس و تیم ملی زیر 17 ساله برزیل شد و تا سال 2013 برای این تیم بازی کرد پیشرفت او در این تیم موجب مقایسه او با بازیکنانی مثل پله و روبینیو شد.